RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXB3-202ENST00000460160 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 HMGCLP35914 325 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CARD9Q9H257 536 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 NUAK1O60285 661 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 HLA-DPA1P20036 260 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 NR1D2Q14995 579 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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HOXB3-202ENST00000460160 OR2AG1Q9H205 316 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RHPN2P1A8MT19 583 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 KCNN4O15554 427 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 B4GAT1O43505 415 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 EML2O95834 649 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ITPKBP27987 946 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXB3-202ENST00000460160 OR1D5P58170 312 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 HES6Q96HZ4 224 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLC46A1Q96NT5 459 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FSD1LQ9BXM9 530 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 HACD3Q9P035 362 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PPM1DO15297 605 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ANXA9O76027 345 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ACP5P13686 325 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PSMB4P28070 264 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CCKBRP32239 447 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GEMP55040 296 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GSDMDP57764 484 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM74Q96NL1 305 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 KCNK6Q9Y257 313 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-202ENST00000460160 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-202ENST00000460160 AGTP01019 485 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ALDH4A1P30038 563 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GPR3P46089 330 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SFRP1Q8N474 314 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA13Q96N96 652 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FICDQ9BVA6 458 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 IL26Q9NPH9 171 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 THSD1Q9NS62 852 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 IL17CQ9P0M4 197 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GPR89AB7ZAQ6 455 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CHUKO15111 745 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GPR89BP0CG08 455 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ADRA1AP35348 466 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ABCG1P45844 678 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 AMZ1Q400G9 498 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 VPS35Q96QK1 796 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 STRADBQ9C0K7 418 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 A6NCN8 305 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 MTX2O75431 263 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FASLGP48023 281 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.39■■□□□ 1.34
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