RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SATB2Q9UPW6 733 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ANXA9O76027 345 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR89BP0CG08 455 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 NR1D2Q14995 579 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC13Q8NBP0 860 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA13Q96N96 652 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP6O43182 974 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GRID2O43424 1007 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 B4GAT1O43505 415 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RANBP10Q6VN20 620 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM74Q96NL1 305 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS35Q96QK1 796 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 IL17CQ9P0M4 197 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1DO15297 605 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT86O43790 486 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 AGTP01019 485 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMB4P28070 264 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCKBRP32239 447 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ADRA1AP35348 466 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR3P46089 330 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 INHBCP55103 352 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2AG1Q9H205 316 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 16.4
UBE2E3-201ENST00000392415 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 C5orf60A6NFR6 353 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CHUKO15111 745 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZW10O43264 779 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 EML2O95834 649 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 FASLGP48023 281 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPSAP1Q14558 356 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SFRP1Q8N474 314 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 FICDQ9BVA6 458 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 IL26Q9NPH9 171 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 LHX6Q9UPM6 363 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 VEGFDO43915 354 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PPFIA2O75334 1257 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ACP5P13686 325 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH4A1P30038 563 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SPAM1P38567 509 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCNKAP51800 687 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1D5P58170 312 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms