RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TIPRLO75663 272 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6V1B2P21281 511 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 APLP1P51693 650 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DIO3P55073 304 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1191Q96A73 305 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA17Q96L03 361 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PSKH2Q96QS6 385 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CIB1Q99828 191 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT3Q9UH03 358 aa16.27■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC160A6NGH7 325 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GPR39O43194 453 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 KLKB1P03952 638 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GRIA3P42263 894 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TM4SF4P48230 202 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PTPRNQ16849 979 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD8Q96I13 439 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MRGBPQ9NV56 204 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CBX4O00257 560 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 INSIG1O15503 277 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TSPAN3O60637 253 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 KERAO60938 352 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NIPSNAP2O75323 286 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFS3O75489 264 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CLPTM1O96005 669 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ATP4BP51164 291 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DHFR2Q86XF0 187 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEH1Q9H213 219 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.26■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D4O60343 1298 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NBNO60934 754 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CKMT2P17540 419 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 IKBKEQ14164 716 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GPNMBQ14956 572 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LINGO4Q6UY18 593 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MIER2Q8N344 545 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 EFHBQ8N7U6 833 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TOP1MTQ969P6 601 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 WBP2Q969T9 261 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TEX37Q96LM6 180 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF599Q96NL3 588 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BIRC8Q96P09 236 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ASB1Q9Y576 335 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BTN3A1O00481 513 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A1P30825 629 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SOX11P35716 441 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CYTH1Q15438 398 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DERL2Q9GZP9 239 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF225Q9UK10 706 aa16.25■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM247A6NEH6 219 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FXYD1O00168 92 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CR2P20023 1033 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LCP2Q13094 533 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TCTN1Q2MV58 587 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 C5orf22Q49AR2 442 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BBS5Q8N3I7 341 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ASB2Q96Q27 587 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ACOX2Q99424 681 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms