RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317025.12

NSD3-202, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSD3, Length 10,776 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3-202ENST00000317025 CILPO75339 1184 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RLN1P04808 185 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 KIR3DL1P43629 444 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RAB43Q86YS6 212 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TAMM41Q96BW9 452 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PPCDCQ96CD2 204 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 UROC1Q96N76 676 aa11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 OR5F1O95221 314 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SDC2P34741 201 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CDCA5Q96FF9 252 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 BTBD9Q96Q07 612 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CNTNAP1P78357 1384 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 OR10H2O60403 315 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CD48P09326 243 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 FAM25EA8MYX2 175 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TRIM32Q13049 653 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 APOLD1Q96LR9 279 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PHF11Q9UIL8 331 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 MAGP20916 626 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 IRGMA1A4Y4 181 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ITPKAP23677 461 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 GPR180Q86V85 440 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TRPV1Q8NER1 839 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 AGAP2Q99490 1192 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SLC5A3P53794 718 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CCDC157Q569K6 752 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 GPR158Q5T848 1215 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 AHI1Q8N157 1196 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 NXNL1Q96CM4 212 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 FCRL4Q96PJ5 515 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RASSF1Q9NS23 344 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TMEM165Q9HC07 324 aa11.63□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 CCDC189A1A4V9 331 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LYPLA2O95372 231 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 COL6A2P12110 1019 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 GPR152Q8TDT2 470 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 S100A13Q99584 98 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ADRA1BP35368 520 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ENPEPQ07075 957 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 IL18Q14116 193 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 FETUBQ9UGM5 382 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TSPAN9O75954 239 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 ASAH2Q9NR71 780 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 C5orf60A6NFR6 353 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PGRMC2O15173 223 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 PLIN3O60664 434 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 OR6A2O95222 327 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 TEX44Q53QW1 395 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 C10orf82Q8WW14 230 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 GNPDA1P46926 289 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 STARP49675 285 aa11.62□□□□□ -0.55
NSD3-202ENST00000317025 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms