RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ADI1Q9BV57 179 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CPQQ9Y646 472 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TRBC1P01850 177 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ACLYP53396 1101 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 S100A14Q9HCY8 104 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AP3D1O14617 1153 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC22A2O15244 555 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IFNA16P05015 189 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 BIKQ13323 160 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IPPKQ9H8X2 491 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 USP46P62068 366 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AGAP2Q99490 1192 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RAB14P61106 215 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FOLH1Q04609 750 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM192Q8IY95 271 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DSELQ8IZU8 1212 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AP2M1Q96CW1 435 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 VMP1Q96GC9 406 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.25■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CDH22Q9UJ99 828 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LRATO95237 230 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 COX10Q12887 443 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LINGO4Q6UY18 593 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AMER2Q8N7J2 671 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HIST1H2ABP04908 130 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RPIAP49247 311 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FITM2Q8N6M3 262 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GMLQ99445 158 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM63AO94886 807 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 STBD1O95210 358 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SSR2P43308 183 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SPIBQ01892 262 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LEMD2Q8NC56 503 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR2T3Q8NH03 318 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 APOLD1Q96LR9 279 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NUAK2Q9H093 628 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.24■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ABLIM1O14639 778 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ASLP04424 464 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IDSP22304 550 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ITPKAP23677 461 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ROPN1LQ96C74 230 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 H0Y858 1186 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 C8GP07360 202 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PTSQ03393 145 aa20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms