RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029446.12

Csde1-201, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Csde1, Length 4,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1-201ENSMUST00000029446 KlO35082 1014 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vps26aP40336 327 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Smpdl3bP58242 456 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 StacP97306 403 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Polr2cP97760 275 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 GaltQ03249 379 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ntrk1Q3UFB7 799 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ampd1Q3V1D3 745 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Phf12Q5SPL2 1003 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rnf145Q5SWK7 663 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mfsd3Q5U419 412 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Crhr2Q60748 411 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Dpy19l3Q71B07 716 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 DcstampQ7TNJ0 470 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Phf24Q80TL4 400 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tmcc2Q80W04 706 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Snx32Q80ZJ7 404 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pgs1Q8BHF7 553 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Prkaa2Q8BRK8 552 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 AgpsQ8C0I1 645 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tmc7Q8C428 726 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Asb14Q8C6Y6 587 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 FggQ8VCM7 436 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Stx18Q8VDS8 334 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Syt12Q920N7 421 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Q9CPZ3 230 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 PompQ9CQT5 141 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Il17rbQ9JIP3 499 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Padi3Q9Z184 664 aa6.99□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ces2gE9PV38 560 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cntnap3E9PY62 1287 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vmn2r5K7N788 911 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Chrna4O70174 629 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 MaptP10637 733 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 P2rx3Q3UR32 397 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr792Q7TRH9 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Q8BL95 290 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gpr20Q8BYC4 358 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Znf451Q8C0P7 1056 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tmem161aQ8VCA6 480 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 B3galt6Q91Z92 325 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lrrc40Q9CRC8 602 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vps28Q9D1C8 221 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ppil6Q9D6D8 278 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 TheglQ9DA15 459 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ddx59Q9DBN9 619 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rnft1Q9DCN7 395 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Wdr54Q9R0D8 334 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 H2afb2S4R1M3 115 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ssxb8B1AY40 170 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 H2-M9O19442 342 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Fpr-rs3O88537 343 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Slc6a20bO88575 635 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tap1P21958 724 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Slc6a13P31649 602 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Nudt1P53368 156 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cyp2c65Q148B1 490 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm45902Q3UDN3 361 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr1128Q7TR47 311 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr213Q7TS32 327 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Disc1Q811T9 852 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Coq9Q8K1Z0 313 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Plac9Q8K262 108 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vps4aQ8VEJ9 437 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 WwoxQ91WL8 414 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 B4galt3Q91YY2 395 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lgals2Q9CQW5 130 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tmem80Q9D3H0 123 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ovca2Q9D7E3 225 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Dusp6Q9DBB1 381 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 RhojQ9ER71 214 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Kat2aQ9JHD2 830 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 ApipQ9WVQ5 241 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cacna1cQ01815 2139 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm5751A2AHC8 147 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr1049A2ARZ0 308 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Znf518bB2RRE4 1077 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rgs4O08899 205 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pbx3O35317 434 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Limk2O54785 638 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 PargO88622 969 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 TtlP38585 377 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Defa8P50706 81 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 UtyP79457 1212 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Znf800Q0VEE6 662 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Bpifa6Q0VGU8 367 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Q3TTL0 348 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Armc7Q3UJZ3 198 aa6.98□□□□□ -1.29
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms