RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027367.13

Ctdsp1-201, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp1, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Trip4Q9QXN3 581 aa20.09■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Oaz3Q9R109 243 aa20.09■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm28043E0CXC2 719 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Stam2O88811 523 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mcpt1P11034 246 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Jak1P52332 1153 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Dnajb14Q149L6 379 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Trappc9Q3U0M1 1148 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ccdc116Q80X53 541 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mppe1Q80XL7 396 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Smad3Q8BUN5 425 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Parp9Q8CAS9 866 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Efhc2Q9D485 750 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Actl7aQ9QY84 440 aa20.08■□□□□ 0.81
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rp1P56716 2095 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Arf5P84084 180 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Jak2Q62120 1129 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Olfr834Q7TRG8 312 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Olfr792Q7TRH9 311 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lrrc27Q80YS5 523 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Slc36a3Q811P0 477 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Disc1Q811T9 852 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Znf689Q8BKK5 500 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fate1Q8CEK7 99 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Olfr695Q8VFM3 315 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lrrc4Q99PH1 652 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zcchc12Q9CZA5 402 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ifrd2Q9D8U0 441 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rgs1Q9JL25 209 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zscan12Q9Z1D7 501 aa20.08■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm4450E9Q007 373 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Kcnc1P15388 511 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Plk2P53351 682 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Myadml2Q08AU7 307 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mdga1Q0PMG2 940 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Znf800Q0VEE6 662 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zfp217Q3U0X6 1041 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Hsd3b4Q61767 373 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Chst10Q6PGK7 356 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Olfr814Q7TRH4 310 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Itpk1Q8BYN3 419 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ipo13Q8K0C1 963 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Usp45Q8K387 813 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nrif1Q923B3 828 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Adad2Q9D5P4 478 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cnbd2Q9D5U8 673 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ttc9bQ9D6E4 239 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 StimateQ3UF25 288 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Armc7Q3UJZ3 198 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zfp606Q7TSV0 794 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tmem198Q8BG75 360 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Q8C5S3 137 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pcdhb18Q91Y02 792 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Catsper1Q91ZR5 686 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Trim8Q99PJ2 551 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Capn10Q9ESK3 666 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gprc5dQ9JIL6 344 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm14401A2ARV7 303 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Prdx3P20108 257 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Inf2Q0GNC1 1273 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Chil6Q80W26 440 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tbx10Q810F8 385 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zbtb33Q8BN78 671 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ca12Q8CI85 354 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Marc1Q9CW42 340 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rnft1Q9DCN7 395 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Olfr220E9Q050 325 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Vmn2r5K7N788 911 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Eno3P21550 434 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Eci1P42125 289 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Stt3aP46978 705 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rps3P62908 243 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 NxnP97346 435 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rbp1Q00915 135 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Bcas1Q80YN3 633 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 C5ar2Q8BW93 344 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fndc3aQ8BX90 1198 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Glod4Q9CPV4 298 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tmem114Q9D563 222 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 MgamB5THE2 1827 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.2 ms