Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Lrrc27Q80YS5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lrrc27Q80YS5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lrrc27Q80YS5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lrrc27Q80YS5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrrc27Q80YS5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Lrrc27Q80YS5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc27Q80YS5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Lrrc27Q80YS5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc27Q80YS5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc27Q80YS5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lrrc27Q80YS5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lrrc27Q80YS5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Lrrc27Q80YS5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Lrrc27Q80YS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lrrc27Q80YS5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lrrc27Q80YS5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Lrrc27Q80YS5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Lrrc27Q80YS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrrc27Q80YS5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrrc27Q80YS5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lrrc27Q80YS5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lrrc27Q80YS5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lrrc27Q80YS5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lrrc27Q80YS5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lrrc27Q80YS5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lrrc27Q80YS5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrc27Q80YS5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrc27Q80YS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lrrc27Q80YS5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Lrrc27Q80YS5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lrrc27Q80YS5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lrrc27Q80YS5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrc27Q80YS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrrc27Q80YS5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrc27Q80YS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc27Q80YS5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc27Q80YS5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc27Q80YS5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc27Q80YS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc27Q80YS5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc27Q80YS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc27Q80YS5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc27Q80YS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc27Q80YS5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lrrc27Q80YS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrrc27Q80YS5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc27Q80YS5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrc27Q80YS5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc27Q80YS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc27Q80YS5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc27Q80YS5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc27Q80YS5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc27Q80YS5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc27Q80YS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc27Q80YS5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc27Q80YS5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc27Q80YS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrrc27Q80YS5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc27Q80YS5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc27Q80YS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc27Q80YS5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc27Q80YS5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc27Q80YS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc27Q80YS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc27Q80YS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc27Q80YS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrrc27Q80YS5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc27Q80YS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrc27Q80YS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc27Q80YS5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc27Q80YS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc27Q80YS5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc27Q80YS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc27Q80YS5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc27Q80YS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc27Q80YS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc27Q80YS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc27Q80YS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc27Q80YS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc27Q80YS5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lrrc27Q80YS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc27Q80YS5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc27Q80YS5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc27Q80YS5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc27Q80YS5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc27Q80YS5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc27Q80YS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc27Q80YS5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc27Q80YS5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc27Q80YS5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc27Q80YS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc27Q80YS5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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