RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 PARP6Q2NL67 630 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 RANBP10Q6VN20 620 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 MAPK15Q8TD08 544 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 NAT6Q93015 286 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.58■□□□□ 0.89
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VARS-218ENST00000459667 METTL18O95568 372 aa20.56■□□□□ 0.88
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VARS-218ENST00000459667 GLYATL1Q969I3 302 aa20.56■□□□□ 0.88
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VARS-218ENST00000459667 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.56■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.56■□□□□ 0.88
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VARS-218ENST00000459667 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
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VARS-218ENST00000459667 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 ARL5AQ9Y689 179 aa20.54■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 RP1P56715 2156 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 C2orf81A6NN90 581 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 NUAK1O60285 661 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 CEP104O60308 925 aa20.53■□□□□ 0.88
VARS-218ENST00000459667 PPFIA2O75334 1257 aa20.53■□□□□ 0.88
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