RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 RRADP55042 308 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TUBB3Q13509 450 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KCNAB1Q14722 419 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CNGA3Q16281 694 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C2CD6Q53TS8 623 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 IRGCQ6NXR0 463 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GJB7Q6PEY0 223 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 Q6ZVL8 140 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MED25Q71SY5 747 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CUZD1Q86UP6 607 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GRHL3Q8TE85 626 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CHST8Q9H2A9 424 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 OGFRQ9NZT2 677 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CD84Q9UIB8 345 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PCSK5Q92824 1860 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BECN2A8MW95 431 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 J3KR12 359 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 E2F3O00716 465 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PMM2O15305 246 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 P4HA2O15460 535 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ALPPP05187 535 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ACP5P13686 325 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 F3P13726 295 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 EDN3P14138 238 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FOLR1P15328 257 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CD1EP15812 388 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CAPN3P20807 821 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SSTR2P30874 369 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SYKP43405 635 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ARL4DP49703 201 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SCNN1BP51168 640 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ART1P52961 327 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GPS2Q13227 327 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ATP1A4Q13733 1029 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LAMB3Q13751 1172 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LRP8Q14114 963 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PTPRRQ15256 657 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MANEALQ5VSG8 457 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRNP1Q6NT89 227 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LZTR1Q8N653 840 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZBTB2Q8N680 514 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 EMC1Q8N766 993 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HDAC11Q96DB2 347 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C18orf8Q96DM3 657 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 DTD2Q96FN9 168 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM51Q9NW97 253 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0G2JNG1 304 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0U1RQS6 177 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 LILRA5A6NI73 299 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 MASP2O00187 686 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SCRG1O75711 98 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PALMO75781 387 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms