RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 FAAH2Q6GMR7 532 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DEF8Q6ZN54 512 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PRELID2Q8N945 189 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CEP41Q9BYV8 373 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 UPB1Q9UBR1 384 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 FABP3P05413 133 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 GOT1P17174 413 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PPP3CAQ08209 521 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ABRQ12979 859 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CRY2Q49AN0 593 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 BORCS5Q969J3 196 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 LGALS13Q9UHV8 139 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 A0A1B0GVM2 712 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TCAF2A6NFQ2 919 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CILPO75339 1184 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SCNN1AP37088 669 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 OMPP47874 163 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ACAP2Q15057 778 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 GCNT6Q5T4J0 391 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DNAAF5Q86Y56 855 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TP53INP1Q96A56 240 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 RETREG1Q9H6L5 497 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 G3V2T6 193 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TEX44Q53QW1 395 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CHST7Q9NS84 486 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 KLRC4O43908 158 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TLR5O60602 858 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 BPGMP07738 259 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 GALNT13Q8IUC8 556 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 OMA1Q96E52 524 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 GLOD4Q9HC38 313 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PRPS2P11908 318 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SELPP16109 830 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ATP1A4Q13733 1029 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 MYBPC3Q14896 1274 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SPESP1Q6UW49 350 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 XPR1Q9UBH6 696 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SCN11AQ9UI33 1791 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 BTN3A3O00478 584 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 IRF6O14896 467 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 WNT3AP56704 352 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 LINC00471Q8N535 108 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CDT1Q9H211 546 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ENTPD5O75356 428 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 IL1BP01584 269 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 MMP3P08254 477 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 FAM153BP0C7A2 387 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 UROSP10746 265 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 NDUFS1P28331 727 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 KHKP50053 298 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 ACBD6Q9BR61 282 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PIF1Q9H611 641 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 CD320Q9NPF0 282 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PIK3C2AO00443 1686 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 NRP2O60462 931 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-202ENST00000373184 MC4RP32245 332 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms