RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF25Q93038 417 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DSN1Q9H410 356 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SDC2P34741 201 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB43Q86YS6 212 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MEIOBQ8N635 442 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PJA1Q8NG27 643 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LRTOMTQ8WZ04 291 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FPGTO14772 594 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX6Q13608 980 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCB9Q9NP78 766 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AP2A2O94973 939 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 BLMHQ13867 455 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR158Q5T848 1215 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PLD5Q8N7P1 536 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL10Q8N8L6 244 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPV3Q8NET8 790 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DERAQ9Y315 318 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DNM1LO00429 736 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PGBD2Q6P3X8 592 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPV1Q8NER1 839 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 BSNDQ8WZ55 320 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 APOLD1Q96LR9 279 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FCRL4Q96PJ5 515 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ASF1AQ9Y294 204 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ELOVL7A1L3X0 281 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNA10Q16322 511 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TYSND1Q2T9J0 566 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC6AQ6EIG7 209 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PLET1Q6UQ28 207 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CBR4Q8N4T8 237 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ASAH2Q9NR71 780 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM22Q9Y584 194 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ISM1B1AKI9 464 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PGK1P00558 417 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 HSF2Q03933 536 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 OAFQ86UD1 273 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CORO1BQ9BR76 489 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MCMBPQ9BTE3 642 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GBA3Q9H227 469 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TPK1Q9H3S4 243 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KA3P51812 740 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SULT1C3Q6IMI6 304 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR152Q8TDT2 470 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FGBP02675 491 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX2P28328 305 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FAUP35544 74 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 JAM2P57087 298 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.05■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IKBKEQ14164 716 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TLCD1Q96CP7 247 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LEMD2Q8NC56 503 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SKA1Q96BD8 255 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF558Q96NG5 402 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4AQ9UMR7 237 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEA3O75764 348 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GMFBP60983 142 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM3Q14832 879 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF8Q7Z7C8 310 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf14Q9HBI5 128 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL9O00512 1426 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CHST10O43529 356 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR5O60602 858 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG2Q9H553 416 aa24.04■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SAGE2PA6NJ88 616 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF11BO00300 401 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGPTL1O95841 491 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms