RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc6a4Q60857 630 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp17laQ61068 526 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sox17Q61473 419 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc39a4Q78IQ7 660 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rdh13Q8CEE7 334 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acsl5Q8JZR0 683 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr847Q8VFF4 312 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TraipQ8VIG6 470 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec16bQ91XT4 1051 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubqln5Q9D4I8 510 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyb5r1Q9DB73 305 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erap1Q9EQH2 930 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spag4Q9JJF2 443 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc2a5Q9WV38 501 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Carm1Q9WVG6 608 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IsxA1A546 240 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gp5O08742 567 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp2O88623 613 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01664 111 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acvr1P37172 509 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp22Q5DU02 525 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rxfp4Q7TQP4 414 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcsk9Q80W65 694 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snx8Q8CFD4 459 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RhoqQ8R527 205 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr570Q8VH12 312 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crtc3Q91X84 619 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Armc1Q9D7A8 282 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr414E9Q5P8 317 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnk4O88454 398 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifrd1P19182 449 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tap1P21958 724 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 St14P56677 855 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpv5P69744 723 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serac1Q3U213 654 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HexdcQ3U4H6 486 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc58Q3UGP9 366 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Parp3Q3ULW8 533 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kansl1lQ5DTI6 991 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TsnQ62348 228 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyth4Q80YW0 393 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrf1Q8VEC3 908 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DcxrQ91X52 244 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lyrm1Q9CQB7 122 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il22bQ9JJY8 179 aa21.98■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prrt4B2RU40 902 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Herc6F2Z461 1003 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gli1P47806 1111 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PepdQ11136 493 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tfap2cQ61312 449 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp719Q8BIV1 735 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fbxo32Q9CPU7 355 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il23aQ9EQ14 196 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TriobpQ99KW3 2014 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2b23E9Q593 491 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spaca6E9Q8Q8 339 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21738J3QP72 227 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sh3pxd2aO89032 1124 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem165P52875 323 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smpdl3bP58242 456 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Akr1c6P70694 323 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SbplQ3TUY3 232 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol9Q3TZX8 714 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pacs2Q3V3Q7 862 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FicdQ8BIX9 458 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dennd2dQ91VV4 469 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usb1Q91W78 267 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B9d1Q9R1S0 204 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tanc1Q0VGY8 1856 aa21.97■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cilp2D3Z7H8 1162 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pbx3O35317 434 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pitx1P70314 315 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wbp2P97765 261 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brsk1Q5RJI5 778 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nfe2l1Q61985 741 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RadilQ69Z89 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmpste24Q80W54 475 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Morc4Q8BMD7 928 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Svs2Q8BS30 375 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec22cQ8BXT9 303 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q8CDN1 933 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taf10Q8K0H5 218 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssh3Q8K330 649 aa21.96■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms