Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
PepdQ11136 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
PepdQ11136 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
PepdQ11136 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,69
PepdQ11136 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
PepdQ11136 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
PepdQ11136 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
PepdQ11136 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
PepdQ11136 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
PepdQ11136 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
PepdQ11136 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
PepdQ11136 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
PepdQ11136 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
PepdQ11136 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
PepdQ11136 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
PepdQ11136 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
PepdQ11136 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PepdQ11136 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
PepdQ11136 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
PepdQ11136 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
PepdQ11136 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
PepdQ11136 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
PepdQ11136 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
PepdQ11136 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
PepdQ11136 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
PepdQ11136 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
PepdQ11136 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
PepdQ11136 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
PepdQ11136 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
PepdQ11136 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
PepdQ11136 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
PepdQ11136 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
PepdQ11136 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
PepdQ11136 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
PepdQ11136 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
PepdQ11136 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
PepdQ11136 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
PepdQ11136 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
PepdQ11136 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
PepdQ11136 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
PepdQ11136 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
PepdQ11136 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
PepdQ11136 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
PepdQ11136 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
PepdQ11136 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
PepdQ11136 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
PepdQ11136 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
PepdQ11136 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
PepdQ11136 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
PepdQ11136 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
PepdQ11136 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
PepdQ11136 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
PepdQ11136 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
PepdQ11136 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
PepdQ11136 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
PepdQ11136 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
PepdQ11136 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
PepdQ11136 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
PepdQ11136 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
PepdQ11136 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
PepdQ11136 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
PepdQ11136 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
PepdQ11136 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
PepdQ11136 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
PepdQ11136 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
PepdQ11136 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
PepdQ11136 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
PepdQ11136 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
PepdQ11136 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
PepdQ11136 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PepdQ11136 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
PepdQ11136 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
PepdQ11136 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PepdQ11136 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
PepdQ11136 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
PepdQ11136 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
PepdQ11136 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
PepdQ11136 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
PepdQ11136 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
PepdQ11136 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
PepdQ11136 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
PepdQ11136 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
PepdQ11136 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
PepdQ11136 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
PepdQ11136 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
PepdQ11136 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
PepdQ11136 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
PepdQ11136 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,71■■□□□ 1,87
PepdQ11136 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
PepdQ11136 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
PepdQ11136 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
PepdQ11136 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
PepdQ11136 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms