RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033012.8

Copb1-201, Transcript of Coatomer subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Copb1, Length 3,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1-201ENSMUST00000033012 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mrm3Q5ND52 418 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Stard3Q61542 446 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tas2r115Q7M719 310 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ms4a5Q810P8 197 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Znf592Q8BHZ4 1262 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn1r79Q8R285 306 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Il36gQ8R460 164 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pla2g15Q8VEB4 412 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Trps1Q925H1 1281 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lrrc4Q99PH1 652 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Micu3Q9CTY5 523 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tnfsf13Q9D777 241 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ap3m1Q9JKC8 418 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ttll6A4Q9E8 822 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm572B1ARY8 399 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Il13ra2O88786 383 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 IapP03975 557 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tbxas1P36423 533 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sesn2P58043 480 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Isl1P61372 349 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pou1f1Q00286 291 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 B3gnt6Q3USF0 391 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Q3UST5 385 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sel1l2Q3V172 688 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cd47Q61735 303 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rftn1Q6A0D4 554 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mical2Q8BML1 960 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Wdr27Q8C5V5 780 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mfsd6Q8CBH5 775 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc36a1Q8K4D3 475 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Acsm1Q91VA0 573 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc44a4Q91VA1 707 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ugp2Q91ZJ5 508 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Kat8Q9D1P2 458 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 2010109A12RikQ9D875 119 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Il21Q9ES17 146 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Aloxe3Q9WV07 711 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 TomtA1Y9I9 258 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn1r2A2AMT6 306 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sult2a3D3Z1W5 285 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r67K7N6T2 851 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm6309L7N481 315 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Bcl7cO08664 217 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Akr1c6P70694 323 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Fam171bQ14CH0 825 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ttc9Q3V038 219 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 EndouQ3V188 412 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pea15Q62048 130 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 RimklaQ6PFX8 380 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Adgrg1Q8K209 687 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dclre1cQ8K4J0 705 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Foxe1Q8R2I0 371 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tas1r3Q925D8 858 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ap1s2Q9DB50 160 aa10□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mup18A2BIM8 181 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Esp18A8R0V1 91 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr543E9PWI5 336 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm3371F7CQW8 167 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mt-CybP00158 381 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mup11P04938 181 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Eno3P21550 434 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Atp5jP97450 108 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 VegfaQ00731 214 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm21320Q4FZE8 181 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Fgfr3Q61851 801 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc13a5Q67BT3 572 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Atg16l2Q6KAU8 623 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Snx6Q6P8X1 406 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Adgrg7Q8BM96 785 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lix1lQ8BQ89 337 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slain2Q8CI08 581 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 B4galt3Q91YY2 395 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cab39lQ9DB16 337 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dpp7Q9ET22 506 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc35a2Q9R0M8 390 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 H2-BlV9GXR0 257 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ect2lA0A140LIP2 953 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr1164A2AVT5 326 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm14744B1AVU4 173 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr287E9PZS7 322 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ceacam3E9Q6J4 706 aa9.99□□□□□ -0.81
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zfp358E9Q8M1 571 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms