RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029421.5

Ptx3-201, Transcript of Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx3, Length 1,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ppp3ccP48455 513 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 CenpcP49452 906 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 E2f2P56931 443 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fitm2P59266 262 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tuba4aP68368 448 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gpr19Q61121 415 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Arhgap30Q640N3 1101 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Lrrc8eQ66JT1 795 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Dnajc15Q78YY6 149 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Trit1Q80UN9 467 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rpp38Q80UU2 280 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fstl5Q8BFR2 847 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slc41a2Q8BYR8 573 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 HscbQ8K3A0 234 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gtse1Q8R080 741 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Brd8Q8R3B7 951 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Nsmce2Q91VT1 247 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Lrrc40Q9CRC8 602 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mpp6Q9JLB0 553 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Clcn5Q9WVD4 746 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cep350E9Q309 3095 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Vmn1r76F8VQ63 324 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Krt1P04104 637 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Got2P05202 430 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gpc4P51655 557 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PrkcgP63318 697 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Adra1dP97714 562 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cyp2c65Q148B1 490 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rbm44Q3V089 1013 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gm5431Q5NCB3 844 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ubr7Q8BU04 425 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tmem259Q8CIV2 574 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Emid1Q91VF5 444 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mrpl17Q9D8P4 176 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Trpc7Q9WVC5 862 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Bscl2Q9Z2E9 383 aa22.15■■□□□ 1.14
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ccdc62E9PVD1 701 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rhox2gL7MUB9 191 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Prkag1O54950 330 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Prox1P48437 737 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rps24P62849 133 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Adcyap1r1P70205 496 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Pitx1P70314 315 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Pld2P97813 933 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 IqcmQ149I8 489 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Fndc3aQ8BX90 1198 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Oas1dQ8VI95 361 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Serpina3nQ91WP6 418 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ndufb5Q9CQH3 189 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PacrglQ9D3X5 248 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Akr1a1Q9JII6 325 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slamf1Q9QUM4 343 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Kat6aQ8BZ21 2003 aa22.14■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Slfn9B1ARD6 910 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zfp780bE9Q2S6 806 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gp5O08742 567 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Mllt10O54826 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Sp1O89090 784 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tap1P21958 724 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Impdh2P24547 514 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zfp607aQ3TQG9 686 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Olfr464Q5SW48 313 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tmem199Q5SYH2 208 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 CcncQ62447 283 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zfp719Q8BIV1 735 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Ccdc32Q8BS39 179 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 GrpQ8R1I2 146 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tex19.1Q99MV2 351 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 KlbQ99N32 1043 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Retreg3Q9CQV4 466 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Marc1Q9CW42 340 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Hormad1Q9D5T7 392 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Gria3Q9Z2W9 888 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Tmem240B2RWJ3 173 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Srp72F8VQC1 671 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Il4i1O09046 630 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Cd151O35566 253 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Pik3cdO35904 1043 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 HcrtO55241 130 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 P01669 111 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Dnajb14Q149L6 379 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Zfp217Q3U0X6 1041 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 MlipQ5FW52 269 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Eif2b4Q61749 524 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Lingo3Q6GQU6 589 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 PdgfrlQ6PE55 375 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Rxfp4Q7TQP4 414 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Noc4lQ8BHY2 516 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Dennd2dQ91VV4 469 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 Spata1Q9D5R4 444 aa22.13■■□□□ 1.13
Ptx3-201ENSMUST00000029421 TsaccQ9DA44 124 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms