RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-218ENST00000568514 HOXC6P09630 235 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 ACTN1P12814 892 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 CPA1P15085 419 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TGM2P21980 687 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 CYP3A7P24462 503 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 CIITAP33076 1130 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 HSPA4P34932 840 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 MCM2P49736 904 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 BEX3Q00994 111 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 GAD2Q05329 585 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 NEDD9Q14511 834 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 PTGR1Q14914 329 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 NECTIN1Q15223 517 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TOMM20Q15388 145 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 RRAGAQ7L523 313 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 RNF144BQ7Z419 303 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 HSCBQ8IWL3 235 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 PDILTQ8N807 584 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 KAT2BQ92831 832 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 HVCN1Q96D96 273 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 SPATA33Q96N06 139 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 C7orf26Q96N11 449 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 TRIM2Q9C040 744 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 LY9Q9HBG7 655 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 PREBQ9HCU5 417 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 RIPK3Q9Y572 518 aa3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNAP23-218ENST00000568514 MYH1P12882 1939 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 MYMKA6NI61 221 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 BECN2A8MW95 431 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 FIBPO43427 364 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 TMEM63AO94886 807 aa3.58□□□□□ -1.84
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SNAP23-218ENST00000568514 CLTBP09497 229 aa3.58□□□□□ -1.84
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SNAP23-218ENST00000568514 CCKARP32238 428 aa3.58□□□□□ -1.84
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SNAP23-218ENST00000568514 KRT2P35908 639 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 POLD2P49005 469 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 ACLYP53396 1101 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 SLC12A1Q13621 1099 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 PKP1Q13835 747 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 TWIST1Q15672 202 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 UBE2SQ16763 222 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 GALNTL6Q49A17 601 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 ZNF280DQ6N043 979 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 USP38Q8NB14 1042 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 HMGB4Q8WW32 186 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 ST8SIA4Q92187 359 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 C8orf76Q96K31 380 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 NLRP4Q96MN2 994 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 REEP2Q9BRK0 252 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 PXMP2Q9NR77 195 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 SMC3Q9UQE7 1217 aa3.58□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 A0A0A0MQY5 61 aa3.57□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.57□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.57□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.57□□□□□ -1.84
SNAP23-218ENST00000568514 E7EVH7 732 aa3.57□□□□□ -1.84
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