RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 ABL2P42684 1182 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SULT1E1P49888 294 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PDX1P52945 283 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 E2F1Q01094 437 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 CDR2Q01850 454 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 DEUP1Q05D60 604 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 CDK18Q07002 472 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 MESDQ14696 234 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.9□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 Q6ZSR6 202 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TRABD2AQ86V40 505 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 FAM72BQ86X60 149 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 VSIG1Q86XK7 387 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ZNF843Q8N446 348 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 KRT35Q92764 455 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 IFT43Q96FT9 208 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 POM121Q96HA1 1249 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 CALN1Q9BXU9 219 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 WDCPQ9H6R7 721 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 IL36AQ9UHA7 158 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ITM2BQ9Y287 266 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.9□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 BSNQ9UPA5 3926 aa5.9□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 IGLON5A6NGN9 336 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 RASA4BC9J798 803 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PDLIM1O00151 329 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 AREL1O15033 823 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 TP73O15350 636 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 RASA4O43374 803 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 AP1G1O43747 822 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CCDC22O60826 627 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 DNAJC6O75061 913 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PEX11AO75192 247 aa5.89□□□□□ -1.47
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USP3-212ENST00000559276 GCATO75600 419 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 FAM155BO75949 473 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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USP3-212ENST00000559276 TGDSO95455 350 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 ACSL3O95573 720 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PRNPP04156 253 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 GP1BAP07359 652 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PLA2G2AP14555 144 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CHRNB2P17787 502 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 OR1E1P30953 314 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 AKT2P31751 481 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PCK1P35558 622 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 ADCY8P40145 1251 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 VHLP40337 213 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 SLCO1A2P46721 670 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 LSSP48449 732 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 NEK3P51956 506 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 ITGA8P53708 1063 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PFN3P60673 137 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 NOMO3P69849 1222 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 DAB2P98082 770 aa5.89□□□□□ -1.47
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USP3-212ENST00000559276 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CBLBQ13191 982 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 MTA1Q13330 715 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 KRT72Q14CN4 511 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 MORF4L2Q15014 288 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 LONRF1Q17RB8 773 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 CARD16Q5EG05 197 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 PERM1Q5SV97 790 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 LRRC38Q5VT99 294 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.89□□□□□ -1.47
USP3-212ENST00000559276 GUSBP11Q6P575 273 aa5.89□□□□□ -1.47
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