RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	INPP4B	O15327	924 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD3	O43242	534 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP2	P08253	660 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PNLIP	P16233	465 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTR1B	P42025	376 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT3A	P56704	352 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	DCDC1	P59894	354 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTR1A	P61163	376 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP4F3	Q08477	520 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	P3H1	Q32P28	736 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LGR4	Q9BXB1	951 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CLPB	Q9H078	707 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	DKK4	Q9UBT3	224 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ACACB	O00763	2458 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CS	O75390	466 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CRTAM	O95727	393 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	FTCD	O95954	541 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PRL	P01236	227 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CEACAM5	P06731	702 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GIMD1	P0DJR0	217 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	RBL1	P28749	1068 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGCL	P35914	325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LMAN1	P49257	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	KY	Q8NBH2	561 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GBA3	Q9H227	469 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD9	Q9H257	536 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRB	P23467	1997 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	KNTC1	P50748	2209 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246		E7EVH7	732 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	USP12	O75317	370 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PYGM	P11217	842 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MYF5	P13349	255 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GM2A	P17900	193 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SPAM1	P38567	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCY8	P40145	1251 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CTBS	Q01459	385 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61

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