RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PIANPQ8IYJ0 282 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 EFHBQ8N7U6 833 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BHMTQ93088 406 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GRIP2Q9C0E4 1043 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa12.82□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 OR1I1O60431 355 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NELFEP18615 380 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ME2P23368 584 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PSME3P61289 254 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HERVK_113P63132 956 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ECT2LQ008S8 904 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TMED1Q13445 227 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TRPC4APQ8TEL6 797 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 STON2Q8WXE9 905 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KLHL32Q96NJ5 620 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZNF599Q96NL3 588 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ERVK-6Q9BXR3 956 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PCDHAC1Q9H158 963 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MID1IP1Q9NPA3 183 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DTNAQ9Y4J8 743 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CDC7O00311 574 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CR2P20023 1033 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FUT4P22083 530 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PCSK6P29122 969 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GALK1P51570 392 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RALGDSQ12967 914 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PLD1Q13393 1074 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ALG1LQ6GMV1 187 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LILRA2Q8N149 483 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KLHL23Q8NBE8 558 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ESAMQ96AP7 390 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FAR2Q96K12 515 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ATOH8Q96SQ7 321 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 COMMD8Q9NX08 183 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FKBPLQ9UIM3 349 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PSMD13Q9UNM6 376 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RAI2Q9Y5P3 530 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ACOT8O14734 319 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SRP72O76094 671 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CD160O95971 181 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 F11P03951 625 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GFAPP14136 432 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A3P40879 764 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PTK2BQ14289 1009 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GRB7Q14451 532 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SQLEQ14534 574 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PITRM1Q5JRX3 1037 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 REP15Q6BDI9 236 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 IYDQ6PHW0 289 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BBS5Q8N3I7 341 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LPGAT1Q92604 370 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GPR21Q99679 349 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC39A3Q9BRY0 314 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MUC3BQ9H195 1237 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AKTIPQ9H8T0 292 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NDUFS3O75489 264 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CRTAMO95727 393 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SUOXP51687 545 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SMARCB1Q12824 385 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LRP8Q14114 963 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TSNQ15631 228 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PTPRNQ16849 979 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GEN1Q17RS7 908 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TYSND1Q2T9J0 566 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FUNDC1Q8IVP5 155 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C19orf60Q96EN9 201 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms