RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462657.1

ANKRD28-207, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-207ENST00000462657 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 AP3D1O14617 1153 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TXNL1O43396 289 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ZBTB14O43829 449 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CEP104O60308 925 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PALMO75781 387 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 FAM155BO75949 473 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TSPAN9O75954 239 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 STAMBPO95630 424 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 POLBP06746 335 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SP1P08047 785 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SCG2P13521 617 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CTPS1P17812 591 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 MYF6P23409 242 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CHMP24386 653 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TTKP33981 857 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ACTN2P35609 894 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CD86P42081 329 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 LIFRP42702 1097 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PTPN9P43378 593 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CENPAP49450 140 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SULT1E1P49888 294 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 KRTAP10-5P60370 271 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CYP4A11Q02928 519 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 LRMPQ12912 555 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 IL13RA2Q14627 380 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 LPIN1Q14693 890 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PPA1Q15181 289 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ME3Q16798 604 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 DCAF6Q58WW2 860 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 XKR9Q5GH70 373 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 OR8H3Q8N146 312 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 NAGSQ8N159 534 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PGBD5Q8N414 524 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 IL17FQ96PD4 163 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TSGA13Q96PP4 275 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 DESI2Q9BSY9 194 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 C2orf40Q9H1Z8 148 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CLSTN2Q9H4D0 955 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CD207Q9UJ71 328 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 NFS1Q9Y697 457 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-207ENST00000462657 KRT87PA6NCN2 255 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CCDC169A6NNP5 214 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 PRAC2D3DTV9 90 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 M0QX08 132 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 MCF2LO15068 1137 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 GOSR1O95249 250 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 VNN2O95498 520 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CBX6O95503 412 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 SERPINC1P01008 464 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CLTBP09497 229 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 ATP1A3P13637 1013 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CD9P21926 228 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 EPS15P42566 896 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 ASMTP46597 345 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 PRKAA2P54646 552 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 PPARDQ03181 441 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CHAF1BQ13112 559 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CUL4BQ13620 913 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 TAF5Q15542 800 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 MMEL1Q495T6 779 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-207ENST00000462657 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms