RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 PAK5Q9P286 719 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX12Q9UMY4 172 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH14Q0VDD8 3507 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS38A1L453 326 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SIGLEC6O43699 453 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 AP2A1O95782 977 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNB1P01574 187 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 IVLP07476 585 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSEP14091 401 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PROX2Q3B8N5 592 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAM1L1Q8N609 369 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC89Q8N998 374 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CLPBQ9H078 707 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 YY2O15391 372 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA6P08133 673 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK4P11802 303 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CKMT2P17540 419 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE1BQ01064 536 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ILKQ13418 452 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf61Q13536 156 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00523Q86TU6 105 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PDXPQ96GD0 296 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 APOL2Q9BQE5 337 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS18Q9P253 973 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PKP3Q9Y446 797 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf81A6NN90 581 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 FFAR2O15552 330 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SUN1O94901 812 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CRTAMO95727 393 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 FUCA1P04066 466 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ACP1P24666 158 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PMLP29590 882 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG11P61952 73 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA5AQ13591 1074 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SPARCL1Q14515 664 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP1B1Q16678 543 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD16Q68DU8 428 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 GKN2Q86XP6 184 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 COG1Q8WTW3 980 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 MS4A14Q96JA4 679 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 RMI1Q9H9A7 625 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 IL26Q9NPH9 171 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CACNA1AO00555 2505 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 INPP4BO15327 924 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 USP12O75317 370 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC4A1P02730 911 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CKMT1AP12532 417 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ETS1P14921 441 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SPAM1P38567 509 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNJ1P48048 391 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 POLD2P49005 469 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 OLIG2Q13516 323 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ALS2CLQ60I27 953 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 APOLD1Q96LR9 279 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS35Q96QK1 796 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 BOCQ9BWV1 1114 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms