RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CACUL1Q86Y37 369 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 IGLV3-19P01714 112 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 AMY1AP04745 511 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 20
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM140Q9NV12 185 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 DEXIO95424 95 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 POLE2P56282 527 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CYP4F2P78329 520 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A9P82251 487 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SHBQ15464 509 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 DCAF6Q58WW2 860 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 RESP18Q5W5W9 173 aa6.4□□□□□ -1.38
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