RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 MIIPQ5JXC2 388 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN33Q86UF1 283 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF677Q86XU0 584 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SPOCK2Q92563 424 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 STK33Q9BYT3 514 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ABCG8Q9H221 673 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SP110Q9HB58 689 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 KCND3Q9UK17 655 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PRKAB1Q9Y478 270 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD11O00231 422 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 UCHL3P15374 230 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GFERP55789 205 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SH3BP2P78314 561 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 DPTQ07507 201 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 IYDQ6PHW0 289 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT13Q8IUC8 556 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PRR7Q8TB68 274 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SH3KBP1Q96B97 665 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ELMO2Q96JJ3 720 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C1Q96RD1 312 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP2Q99490 1192 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 WIPF3A6NGB9 483 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GFPT2O94808 682 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA10O95299 355 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD34CP0C6C1 535 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 UNGP13051 313 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 EPHA4P54764 986 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 GSCP56915 257 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 IL10RBQ08334 325 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A7Q0GE19 358 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CHAF1BQ13112 559 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 DNASE1L3Q13609 305 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LRP8Q14114 963 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RASGRP3Q8IV61 690 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LZTR1Q8N653 840 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SCAMP4Q969E2 229 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TCTN2Q96GX1 697 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf72Q96LT7 481 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PSKH2Q96QS6 385 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB18PQ96TA0 734 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM22Q9P0K1 906 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1468Q9P260 1216 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PHTF1Q9UMS5 762 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQ67 120 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 DFFAO00273 331 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SOCS5O75159 536 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ASMTLO95671 621 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RECKO95980 971 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CTPS1P17812 591 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SEPHS1P49903 392 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 AIF1P55008 147 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF2Q12933 501 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LBRQ14739 615 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CA9Q16790 459 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CPZQ66K79 652 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9B2Q86UD5 537 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TP53INP2Q8IXH6 220 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CT55Q8WUE5 264 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 AP2M1Q96CW1 435 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RUFY1Q96T51 708 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A23Q9BV35 468 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 MLXIPLQ9NP71 852 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 DONSONQ9NYP3 566 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 OGFRQ9NZT2 677 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 LUZP4Q9P127 313 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CSMD1Q96PZ7 3565 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 A6NCN8 305 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 C9P02748 559 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 CCNYL3P0C7X3 344 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RENBPP51606 427 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 PGDP52209 483 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD12-201ENST00000404162 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms