RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 NOBOXO60393 691 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 PMPCBO75439 489 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 NFKB1P19838 968 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.872e-18■■■■■ 34.1
UBE2E3-201ENST00000392415 ISXQ2M1V0 245 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 PID1Q7Z2X4 250 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ALG3Q92685 438 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 FCRL5Q96RD9 977 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 DESI2Q9BSY9 194 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 UBP1Q9NZI7 540 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 RAXQ9Y2V3 346 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 EPOP01588 193 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 PIRTP0C851 137 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 GLB1P16278 677 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ADCY8P40145 1251 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC181Q5TID7 509 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 DOK6Q6PKX4 331 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 KDELC1Q6UW63 502 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM74Q86UV6 250 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTL9Q8TC94 416 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 AMFRQ9UKV5 643 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF711Q9Y462 761 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ITPR1Q14643 2758 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0U1RQJ8 604 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 INPP4BO15327 924 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 USP12O75317 370 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 PYGMP11217 842 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 RBL1P28749 1068 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 CETN2P41208 172 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 CTBSQ01459 385 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 PYCR3Q53H96 274 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 PEX26Q7Z412 305 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH19Q9H159 772 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 TAAR2Q9P1P5 351 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS18Q9P253 973 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 APPL1Q9UKG1 709 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 B4DGG1 531 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 H7C0C1 242 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF1P05230 155 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 PNLIPP16233 465 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP5OP48047 213 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT3AP56704 352 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 DCDC1P59894 354 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 SPIDRQ14159 915 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 AADACL2Q6P093 401 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR26Q8NDV2 337 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2M4Q96R27 311 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD18Q9NS91 495 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 BRINP1O60477 761 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC6O75061 913 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 TJP3O95049 919 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 ASMTLO95671 621 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 MPP3Q13368 585 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 PEX6Q13608 980 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms