RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SETD4Q9NVD3 440 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CROTQ9UKG9 612 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQU0 124 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NEMP1O14524 444 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS4O75173 837 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GPC4O75487 556 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DGKIO75912 1065 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CPNE6O95741 557 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C2P06681 752 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ELNP15502 786 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MGAT1P26572 445 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC8P31273 242 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRK4P32298 578 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCYT1AP49585 367 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HLCSP50747 726 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 BEX3Q00994 111 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A3Q01959 620 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 INCA1Q0VD86 236 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GK3PQ14409 553 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC36A3Q495N2 470 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MTX3Q5HYI7 312 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 COQ5Q5HYK3 327 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM135Q86UB9 458 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK15Q8TD08 544 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 STYXQ8WUJ0 223 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LPGAT1Q92604 370 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RDH12Q96NR8 316 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP3Q96P47 875 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CIB1Q99828 191 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PSD2Q9BQI7 771 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TASP1Q9H6P5 420 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 EBF1Q9UH73 591 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PSME2Q9UL46 239 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087X1B8 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN25C9JDP6 229 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 K7EPI3 171 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 M0QZ92 97 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 UBDO15205 165 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CLOCKO15516 846 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GRID2O43424 1007 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KDM1AO60341 852 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RASAL1O95294 804 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HSD17B1P14061 328 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AXLP30530 894 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ARRB2P32121 409 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CAPGP40121 348 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ADH7P40394 386 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB10P48595 397 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 AIF1P55008 147 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM17P78536 824 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PRKCQQ04759 706 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 NFATC3Q12968 1075 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PEX6Q13608 980 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 LRP8Q14114 963 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 RAB39AQ14964 217 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KIZQ2M2Z5 673 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms