RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 HOXD12P35452 270 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 NAA20P61599 178 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 FUT11Q495W5 492 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZNX1 250 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ATP2A3Q93084 1043 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 E2F7Q96AV8 911 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 POMPQ9Y244 141 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GJB3O75712 270 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 AP2A1O95782 977 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PLK1P53350 603 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 DSC2Q02487 901 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ITKQ08881 620 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CHI3L2Q15782 390 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 HPS4Q9NQG7 708 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM247A6NEH6 219 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM24O15164 1050 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 NFATC1O95644 943 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CRTAMO95727 393 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 STT3AP46977 705 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SLC12A1Q13621 1099 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 BMPR2Q13873 1038 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PRPSAP1Q14558 356 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CYTH1Q15438 398 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ATG16L1Q676U5 607 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf40Q86WS4 652 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 HPS6Q86YV9 775 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 AHI1Q8N157 1196 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT3Q9UH03 358 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 H3BNX3 289 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 UGT1A9O60656 530 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KCNA5P22460 613 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PDGFRLQ15198 375 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PSKH2Q96QS6 385 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 MGME1Q9BQP7 344 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PLLPQ9Y342 182 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 USP12O75317 370 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 MT-CO1P00395 513 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 C1QAP02745 245 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 MMP2P08253 660 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 AOC1P19801 751 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 NR1H2P55055 460 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 IHHQ14623 411 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GAB4Q2WGN9 574 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GIPC3Q8TF64 312 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ACDQ96AP0 544 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 BIRC5O15392 142 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ANXA9O76027 345 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PSMC3P17980 439 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEA3P43357 314 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RGRP47804 291 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 COPAP53621 1224 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 BORAQ6PGQ7 559 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC2Q96KP1 924 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO10Q9UK96 956 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms