RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216044.9

GTPBP1-201, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP1, Length 5,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-201ENST00000216044 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 DMPKQ09013 629 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 BICRALQ6AI39 1079 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 APOPT1Q96IL0 206 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CLN6Q9NWW5 311 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SGTAO43765 313 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ATP6V1G2O95670 118 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CSF2RAP15509 400 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SGCGQ13326 291 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ATL1Q8WXF7 558 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PGM2Q96G03 612 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SERAC1Q96JX3 654 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TEX46H3BTG2 121 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ALADP13716 330 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC1A6P48664 564 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ALDH9A1P49189 494 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ACTR3P61158 418 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PLIN5Q00G26 463 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ZBTB6Q15916 424 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 RFX4Q33E94 735 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CD101Q93033 1021 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CRELD1Q96HD1 420 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SYT11Q9BT88 431 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 IL22Q9GZX6 179 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 EHD3Q9NZN3 535 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CHN2P52757 468 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PROSER1Q86XN7 944 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ARL10Q8N8L6 244 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PWWP2AQ96N64 755 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CD248Q9HCU0 757 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PIGVQ9NUD9 493 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PRMT3O60678 531 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CLDN11O75508 207 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SEMA3DO95025 777 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ABHD2P08910 425 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TSHRP16473 764 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TACR2P21452 398 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MAGEA11P43364 429 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 IGSF21Q96ID5 467 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CCL16O15467 120 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ACSL4O60488 711 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 IGSF6O95976 241 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 KCNMB4Q86W47 210 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MNTQ99583 582 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SCML2Q9UQR0 700 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 KPNA5O15131 536 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SEC22BO75396 215 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ALOX5P09917 674 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CD86P42081 329 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 BROXQ5VW32 411 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SEPHS2Q99611 448 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.56□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NUDT14O95848 222 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SOD2P04179 222 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NUDT17P0C025 328 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SYN1P17600 705 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MYL9P24844 172 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 GLRBP48167 497 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CCNIQ14094 377 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 C5orf22Q49AR2 442 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CES3Q6UWW8 571 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 RNF145Q96MT1 663 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 YIPF1Q9Y548 306 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 A0A0X1KG70 313 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MTMR11A4FU01 709 aa14.55□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 QSOX1O00391 747 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms