RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrif1Q923B3 828 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gimap3Q99MI6 301 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pin4Q9CWW6 131 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Borcs5Q9D920 195 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Paqr5Q9DCU0 330 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube4bQ9ES00 1173 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il22Q9JJY9 179 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dthd1E9PZX1 795 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh18E9Q9Q6 790 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13128L7MU96 475 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Top3aO70157 1003 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scrg1O88745 98 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp14P10755 501 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd3P14685 530 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Folr1P35846 255 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptk7Q8BKG3 1062 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mab21L3Q8CI17 429 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam192aQ91WE2 254 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Haus8Q99L00 373 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atoh8Q99NA2 322 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wars2Q9CYK1 360 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acer3Q9D099 267 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam83dQ9D7I8 585 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ampd2Q9DBT5 798 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dmap1Q9JI44 468 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DgkeQ9R1C6 564 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Skint11A7XV14 364 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm28043E0CXC2 719 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8444F6XS56 118 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr292F8VQ84 308 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prkag1O54950 330 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr25P0C5I1 358 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SrgnP13609 152 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neurog1P70660 244 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnksr3Q8BMA3 555 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AcadsbQ9DBL1 432 aa21■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc2a4P14142 509 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pou4f1P17208 421 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F3P20352 294 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fdft1P53798 416 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt80Q0VBK2 452 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TCAIMQ66JZ4 499 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chil6Q80W26 440 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aqp12Q8CHJ2 290 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrf1Q8VEC3 908 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem30aQ8VEK0 364 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AslQ91YI0 464 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf11Q99JX1 211 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CrotQ9DC50 612 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrip2Q9JHR9 270 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LifP09056 203 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coq10bQ3THF9 240 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tab3Q571K4 716 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clhc1Q5M6W3 596 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il17aQ62386 158 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vwa2Q70UZ7 791 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam107aQ78TU8 144 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ckap2lQ7TS74 745 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb33Q8BN78 671 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnpy4Q8BQ47 245 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cops7bQ8BV13 264 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nlrp10Q8CCN1 673 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsl1Q8K305 281 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35b2Q91ZN5 431 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdia5Q921X9 517 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Echdc3Q9D7J9 300 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh13Q9WTR5 714 aa20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3173A6NAS3 172 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3020E9Q3J7 150 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2897K7N6T7 172 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MrasO08989 208 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HexdcQ3U4H6 486 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mks1Q5SW45 561 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crhr2Q60748 411 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Six3Q62233 333 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kirrel2Q7TSU7 700 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nat14Q8BVG8 206 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3411Q8C7R2 150 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam155aQ8CCS2 467 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnip2Q99JG7 430 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hormad1Q9D5T7 392 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htatip2Q9Z2G9 242 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pramef17A2ASJ1 475 aa20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MycP01108 439 aa20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdprhP54923 362 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms