RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029907.5

Ubxn2b-201, Transcript of UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn2b, Length 6,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Top3aO70157 1003 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 M6prP24668 278 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Arhgef38Q80VK6 770 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cmc1Q9CPZ8 106 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mageb4A2A9R3 556 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tfap2aP34056 437 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pim3P58750 326 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pfdn6Q03958 127 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Six3Q62233 333 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Svs2Q8BS30 375 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PigwQ8C398 503 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr273Q8VG87 317 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 RhoaQ9QUI0 193 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Krt6bQ9Z331 562 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm21738J3QP72 227 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 LdhcP00342 332 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Upf3aQ3ULJ3 422 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc6a3Q61327 619 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nsmce2Q91VT1 247 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Trpc4apQ9JLV2 797 aa9.56□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cylc2B1AWN8 422 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm2832F7AEC7 200 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Kcna3P16390 528 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gnat1P20612 350 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Treml2Q2LA85 329 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zbtb33Q8BN78 671 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc46a2Q8CA03 479 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Snapc1Q8K0S9 389 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Abhd11Q8K4F5 307 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 WwoxQ91WL8 414 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Speer4f2E9Q366 295 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Aff3P51827 1254 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nod1Q8BHB0 953 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmc7Q8C428 726 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Stx5Q8K1E0 355 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nae1Q8VBW6 534 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc44a3Q921V7 656 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fcf1Q9CTH6 198 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fam83dQ9D7I8 585 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 CrotQ9DC50 612 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Skint11A7XV14 364 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rundc3aO08576 446 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 SpnP15702 395 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Psme3P61290 254 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ostm1Q8BGT0 338 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Smad3Q8BUN5 425 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Trim35Q8C006 501 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Marc1Q9CW42 340 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ampd2Q9DBT5 798 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Il22Q9JJY9 179 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slamf1Q9QUM4 343 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Neu1O35657 409 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Kcna4Q61423 654 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fam126aQ6P9N1 521 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gramd1bQ80TI0 738 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmcc2Q80W04 706 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 TdrpQ8C5P7 182 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rnf31Q924T7 1066 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tex19.1Q99MV2 351 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Trip4Q9QXN3 581 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mcf2A2AEU1 1111 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm28043E0CXC2 719 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Srp72F8VQC1 671 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Chil6Q80W26 440 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ubr7Q8BU04 425 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr809Q8VEX8 328 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Adam17Q9Z0F8 827 aa9.55□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Umodl1Q5DID3 1319 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gbp11A9YVJ5 442 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm13128L7MU96 475 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Prdx3P20108 257 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Arf5P84084 180 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pnrc1Q3TWH3 297 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mocs1Q5RKZ7 636 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 VwdeQ6DFV8 926 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 GsdmcQ99NB5 468 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cpxm2Q9D2L5 764 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ccdc130Q9D516 385 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Hao2Q9NYQ2 353 aa9.54□□□□□ -0.88
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms