Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Neu1O35657 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Neu1O35657 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Neu1O35657 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Neu1O35657 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Neu1O35657 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Neu1O35657 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Neu1O35657 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Neu1O35657 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Neu1O35657 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Neu1O35657 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Neu1O35657 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Neu1O35657 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Neu1O35657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Neu1O35657 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Neu1O35657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Neu1O35657 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Neu1O35657 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Neu1O35657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Neu1O35657 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Neu1O35657 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Neu1O35657 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Neu1O35657 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Neu1O35657 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neu1O35657 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Neu1O35657 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neu1O35657 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Neu1O35657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Neu1O35657 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Neu1O35657 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Neu1O35657 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Neu1O35657 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Neu1O35657 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Neu1O35657 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Neu1O35657 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Neu1O35657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Neu1O35657 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Neu1O35657 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Neu1O35657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Neu1O35657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Neu1O35657 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Neu1O35657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Neu1O35657 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Neu1O35657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Neu1O35657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Neu1O35657 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Neu1O35657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Neu1O35657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Neu1O35657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Neu1O35657 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Neu1O35657 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Neu1O35657 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Neu1O35657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Neu1O35657 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Neu1O35657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Neu1O35657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Neu1O35657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Neu1O35657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Neu1O35657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Neu1O35657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Neu1O35657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Neu1O35657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Neu1O35657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Neu1O35657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Neu1O35657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Neu1O35657 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Neu1O35657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Neu1O35657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Neu1O35657 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Neu1O35657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Neu1O35657 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Neu1O35657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Neu1O35657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Neu1O35657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Neu1O35657 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Neu1O35657 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Neu1O35657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Neu1O35657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Neu1O35657 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Neu1O35657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Neu1O35657 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Neu1O35657 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Neu1O35657 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Neu1O35657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Neu1O35657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Neu1O35657 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Neu1O35657 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Neu1O35657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Neu1O35657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Neu1O35657 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Neu1O35657 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Neu1O35657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Neu1O35657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Neu1O35657 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Neu1O35657 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Neu1O35657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Neu1O35657 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Neu1O35657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Neu1O35657 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Neu1O35657 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms