Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Neu1O35657 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Neu1O35657 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Neu1O35657 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Neu1O35657 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Neu1O35657 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Neu1O35657 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Neu1O35657 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Neu1O35657 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Neu1O35657 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Neu1O35657 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Neu1O35657 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Neu1O35657 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Neu1O35657 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Neu1O35657 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Neu1O35657 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neu1O35657 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Neu1O35657 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Neu1O35657 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Neu1O35657 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Neu1O35657 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Neu1O35657 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Neu1O35657 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Neu1O35657 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Neu1O35657 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Neu1O35657 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Neu1O35657 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Neu1O35657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Neu1O35657 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Neu1O35657 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Neu1O35657 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Neu1O35657 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neu1O35657 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Neu1O35657 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neu1O35657 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neu1O35657 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Neu1O35657 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neu1O35657 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neu1O35657 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neu1O35657 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Neu1O35657 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neu1O35657 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neu1O35657 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neu1O35657 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neu1O35657 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neu1O35657 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neu1O35657 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neu1O35657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neu1O35657 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neu1O35657 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neu1O35657 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Neu1O35657 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neu1O35657 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neu1O35657 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neu1O35657 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neu1O35657 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Neu1O35657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neu1O35657 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neu1O35657 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Neu1O35657 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Neu1O35657 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Neu1O35657 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Neu1O35657 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Neu1O35657 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neu1O35657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Neu1O35657 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Neu1O35657 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neu1O35657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neu1O35657 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neu1O35657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neu1O35657 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Neu1O35657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neu1O35657 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neu1O35657 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Neu1O35657 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Neu1O35657 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Neu1O35657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Neu1O35657 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neu1O35657 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neu1O35657 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Neu1O35657 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Neu1O35657 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Neu1O35657 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Neu1O35657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Neu1O35657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Neu1O35657 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neu1O35657 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neu1O35657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neu1O35657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neu1O35657 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Neu1O35657 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Neu1O35657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Neu1O35657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Neu1O35657 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Neu1O35657 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Neu1O35657 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Neu1O35657 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Neu1O35657 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Neu1O35657 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Neu1O35657 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms