RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gemin2Q9CQQ4 269 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il23aQ9EQ14 196 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NckipsdQ9ESJ4 714 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prg3Q9JL95 222 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpc4apQ9JLV2 797 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp4a12bA2A974 508 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700001O22RikA2APZ1 375 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BrafP28028 804 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sstr4P49660 385 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pla2g5P97391 137 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a15Q504N2 544 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sox17Q61473 419 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim62Q80V85 475 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snrnp27Q8K194 155 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Batf2Q8R1H8 277 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a9Q8VDT1 685 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dio3Q91ZI8 304 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atoh8Q99NA2 322 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr14lE9Q7C4 1971 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan5bB2RTN3 468 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp780bE9Q2S6 806 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Azin1O35484 448 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apoa4P06728 395 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ebf1Q07802 591 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp607aQ3TQG9 686 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp22Q5DU02 525 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MelkQ61846 643 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zzz3Q6KAQ7 910 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B3gnt5Q8BGY6 376 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mab21L3Q8CI17 429 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lgals12Q91VD1 314 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actl7aQ9QY84 440 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pate1E9Q658 125 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr726E9Q8X3 321 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Timm13P62075 95 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr725Q05A45 321 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LcorlQ3U285 600 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HexdcQ3U4H6 486 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SvoplQ6PDF3 494 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7247Q6UY52 187 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chil6Q80W26 440 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc13a3Q91Y63 600 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FcrlaQ920A9 352 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rad51cQ924H5 366 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn19Q9ET38 224 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asah2Q9JHE3 756 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1145A2AVC7 325 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpx3P46412 226 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndst2P52850 883 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BmxP97504 651 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc58Q3UGP9 366 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uimc1Q5U5Q9 727 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntn2Q61330 1040 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actr3bQ641P0 418 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc13a5Q67BT3 572 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtmr12Q80TA6 747 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxl20Q9CZV8 436 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il22bQ9JJY8 179 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssxb6A2BI74 170 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DdcO88533 480 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gria2P23819 883 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Impdh2P24547 514 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acvr1P37172 509 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stt3aP46978 705 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 InhbcP55104 352 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tuba4aP68368 448 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpv5P69744 723 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zyg11bQ3UFS0 744 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Parp3Q3ULW8 533 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnpla1Q3V1D5 599 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpa4Q6P8K8 420 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Amigo1Q80ZD8 492 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifi205aQ8CGE8 404 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BfarQ8R079 450 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr570Q8VH12 312 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Batf3Q9D275 118 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc28a3Q9ERH8 703 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hao2Q9NYQ2 353 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tanc1Q0VGY8 1856 aa17■□□□□ 0.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C6E9Q6D8 931 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.6 ms