RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, human

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF4-218	ENST00000513284	RASA4	O43374	803 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	IVL	P07476	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ELFN1	P0C7U0	828 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MAN1A1	P33908	653 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ACTR1B	P42025	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CCL11	P51671	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NDST2	P52849	883 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	BPIFB4	P59827	614 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ACTR1A	P61163	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SH3BP2	P78314	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CDK3	Q00526	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ACOX1	Q15067	660 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PTPRR	Q15256	657 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ARC	Q7LC44	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SRL	Q86TD4	932 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TACC2	O95359	2948 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CSNK1D	P48730	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PGD	P52209	483 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	GRM3	Q14832	879 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NR6A1	Q15406	480 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	INPP4B	O15327	924 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CEACAM4	O75871	244 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TIAF1	O95411	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SOD1	P00441	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NFKBIA	P25963	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PON1	P27169	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ETV3	P41162	512 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	GFER	P55789	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	HDAC4	P56524	1084 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	FOXM1	Q08050	763 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NFATC2	Q13469	925 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CNGA3	Q16281	694 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	CDO1	Q16878	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	NUS1	Q96E22	293 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284		A0A0U1RQS6	177 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNF4-218	ENST00000513284	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63

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