RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496447.5

PTPRF-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 5,887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-215ENST00000496447 SPAM1P38567 509 aa13.13□□□□□ -0.31
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PTPRF-215ENST00000496447 LIPMQ5VYY2 423 aa13.13□□□□□ -0.31
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PTPRF-215ENST00000496447 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-215ENST00000496447 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-215ENST00000496447 SLIT3O75094 1523 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-215ENST00000496447 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRF-215ENST00000496447 SMIM11AP58511 58 aa13.12□□□□□ -0.31
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