RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPG21Q9NZD8 308 aa25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LHX3Q9UBR4 397 aa25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 MED16Q9Y2X0 877 aa25.2■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC189A1A4V9 331 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LATS1O95835 1130 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA31D3P0C874 917 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMA3P25788 255 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 MC4RP32245 332 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH13P55290 713 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PFKFB4Q16877 469 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 JADE3Q92613 823 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0U1RQS6 177 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTHFD2P13995 350 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 HDCP19113 662 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 RHOAP61586 193 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHSY3Q70JA7 882 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPQQ9Y646 472 aa25.19■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 STX7O15400 261 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 GREM1O60565 184 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSKP41240 450 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPRNQ16849 979 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIANPQ8IYJ0 282 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 WFDC5Q8TCV5 224 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.18■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBDO15205 165 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LAG3P18627 525 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 INHBCP55103 352 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH18Q13634 790 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDRT15Q96T59 188 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINI1Q99574 410 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 VPS51Q9UID3 782 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR51B4Q9Y5P0 310 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC14BA6NHZ5 514 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CFLARO15519 480 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 GFAPP14136 432 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAD51Q06609 339 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ART3Q13508 389 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 GK5Q6ZS86 529 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA1191Q96A73 305 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 BIRC8Q96P09 236 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPR21Q99679 349 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPAS2Q99743 824 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 DERL2Q9GZP9 239 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL21Q9HBE4 155 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.17■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPC4O75487 556 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SH3BP2P78314 561 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITIH5Q86UX2 942 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 KBTBD2Q8IY47 623 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PGAM4Q8N0Y7 254 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.16■■□□□ 1.62
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PLEKHF1-201ENST00000436066 GALPQ9UBC7 116 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 STK39Q9UEW8 545 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF112Q9ULX5 631 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 LCHNA4D1U4 455 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 TEX28O15482 410 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR1I1O60431 355 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 KERAO60938 352 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 MT-CO1P00395 513 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 CA8P35219 290 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTPAP49638 278 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 Q6ZNB5 142 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR41Q9HAD4 459 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.16■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUPT3HB4E1H0 165 aa25.15■■□□□ 1.62
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP6CO00743 305 aa25.15■■□□□ 1.62
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