RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 IQCF5A8MTL0 148 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ARVCFO00192 962 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CABYRO75952 493 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MMP2P08253 660 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HOXD10P28358 340 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CPOXP36551 454 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CASP2P42575 452 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ECT2LQ008S8 904 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEMA3AQ14563 771 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TAS2R42Q7RTR8 314 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LSMEM2Q8N112 164 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 STYXQ8WUJ0 223 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CASD1Q96PB1 797 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KCNA7Q96RP8 456 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CCT7Q99832 543 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 BTRCQ9Y297 605 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UBXN8O00124 270 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MATN2O00339 956 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 VILLO15195 856 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GRID2O43424 1007 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 VNN2O95498 520 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GLP2RO95838 553 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SERPINF2P08697 491 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 AOC1P19801 751 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HALP42357 657 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PLIN5Q00G26 463 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SULT2A1Q06520 285 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LHX8Q68G74 356 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL35Q6PF15 583 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM207Q6UWW9 146 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 C8orf48Q96LL4 319 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DRC3Q9H069 523 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RNF38Q9H0F5 515 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TLR9Q9NR96 1032 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TREX1Q9NSU2 369 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 A8MT66 165 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RHOBTB1O94844 696 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ALDH1A1P00352 501 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KLKB1P03952 638 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RHOCP08134 193 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CDH15P55291 814 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RALGDSQ12967 914 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PRKAA1Q13131 559 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SERINC3Q13530 473 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CAMK2BQ13554 666 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GPNMBQ14956 572 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KIF19Q2TAC6 998 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 AGAP9Q5VTM2 703 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ARRDC2Q8TBH0 407 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEPT8Q92599 483 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC22A12Q96S37 553 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RNF208Q9H0X6 261 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DNAJC28Q9NX36 388 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FAM8A1Q9UBU6 413 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.09□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 COCHO43405 550 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 OR1I1O60431 355 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 SEC24AO95486 1093 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 RXRGP48443 463 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 C1QTNF8P60827 252 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 AGKQ53H12 422 aa10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
FOXN4-201ENST00000299162 FAAH2Q6GMR7 532 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms