RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 AMD1P17707 334 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 LMO2P25791 158 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF516Q92618 1163 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CEP78Q5JTW2 689 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OR8H2Q8N162 312 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NXNL1Q96CM4 212 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FAM155BO75949 473 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 C4BPBP20851 252 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GNPDA1P46926 289 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SLC7A2P52569 658 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PDK3Q15120 406 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 DTLQ9NZJ0 730 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 A0A0J9YYE9 177 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FAM25AB3EWG3 89 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FAM25CB3EWG5 89 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FAM25GB3EWG6 89 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ADAMTS3O15072 1205 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PLIN3O60664 434 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TSPAN19P0C672 248 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SFRP1Q8N474 314 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PRNPP04156 253 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FYNP06241 537 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SPESP1Q6UW49 350 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GSSP48637 474 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NR1H2P55055 460 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TRAF3Q13114 568 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CNTD1Q8N815 330 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 HMCESQ96FZ2 354 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SERHLQ9NQF3 203 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FNIP2Q9P278 1114 aa20.32■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NDUFS2O75306 463 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SERPINB7O75635 380 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SERPINI2O75830 405 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD3Q96ES6 412 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TBATAQ96M53 351 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TCEA3O75764 348 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 DNTTP04053 509 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NDUFV1P49821 464 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 RIPK1Q13546 671 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TAF5Q15542 800 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CHSY3Q70JA7 882 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GPR156Q8NFN8 814 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CENPXA8MT69 81 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PER2O15055 1255 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GSC2O15499 205 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PRKAG1P54619 331 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF536O15090 1300 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 STX11O75558 287 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CST1P01037 141 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NR2F1P10589 423 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 BNIP1Q12981 228 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 C17orf64Q86WR6 236 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PPCDCQ96CD2 204 aa20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms