RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR1AP61163 376 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RHOAP61586 193 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 CETN1Q12798 172 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PAK1Q13153 545 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PEX6Q13608 980 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MANEALQ5VSG8 457 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 LIPIQ6XZB0 460 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 HPS6Q86YV9 775 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SFRP1Q8N474 314 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 TBCBQ99426 244 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEH1Q9H213 219 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.35■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 LHX3Q9UBR4 397 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL3Q9UH77 587 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.35■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 NEU3Q9UQ49 428 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 C21orf140B9A014 251 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS44E7EML9 344 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 F9P00740 461 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ELFN1P0C7U0 828 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 ADCY8P40145 1251 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 LAMB3Q13751 1172 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BNIPLQ7Z465 357 aa16.34■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 IQCKQ8N0W5 287 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SEC14L1Q92503 715 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 NCSTNQ92542 709 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC2Q96KP1 924 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 RUFY1Q96T51 708 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT9Q9BW91 350 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 TEX101Q9BY14 249 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
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SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 SEC16AO15027 2179 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-201ENST00000233025 BECN2A8MW95 431 aa16.33■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 BUB1O43683 1085 aa16.33■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA10O95299 355 aa16.33■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.33■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 PADI1Q9ULC6 663 aa16.33■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.33■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 IVLP07476 585 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SPTBP11277 2137 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ACANP16112 2415 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RHOQP17081 205 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PER3P56645 1201 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 GJB7Q6PEY0 223 aa16.32■□□□□ 0.2
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SPCS1-201ENST00000233025 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 KLC2Q9H0B6 622 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 ZG16O60844 167 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 EML2O95834 649 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PTGER4P35408 488 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 PTGIRP43119 386 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 POLD2P49005 469 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 EPHA4P54764 986 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 SH3BP2P78314 561 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CDK3Q00526 305 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 HHEXQ03014 270 aa16.31■□□□□ 0.2
SPCS1-201ENST00000233025 CDK18Q07002 472 aa16.31■□□□□ 0.2
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