RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	COL6A2	P12110	1019 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	TALDO1	P37837	337 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SSR2	P43308	183 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	CHRNB2	P17787	502 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	DGKG	P49619	791 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	GAD2	Q05329	585 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	CACNG1	Q06432	222 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	IL10RB	Q08334	325 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.77	□□□□□ -0.2
RAB18-208	ENST00000611151	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	VNN1	O95497	513 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	IDO1	P14902	403 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GPD2	P43304	727 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RABGGTB	P53611	331 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	USP4	Q13107	963 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	NELL1	Q92832	810 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RFXANK	O14593	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	UNC5C	O95185	931 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LRAT	O95237	230 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	BPGM	P07738	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ITPKA	P23677	461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FPGS	Q05932	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GPR21	Q99679	349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	VIP	P01282	170 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RORB	Q92753	470 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	GML	Q99445	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF536	O15090	1300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	STK16	O75716	305 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	PMM2	O15305	246 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	JAG1	P78504	1218 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAB18-208	ENST00000611151	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms