RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 CNBD1Q8NA66 436 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 BEST2Q8NFU1 509 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM58Q8NG06 486 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PSMD1Q99460 953 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 CMKLR1Q99788 373 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SYT17Q9BSW7 474 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 NOD2Q9HC29 1040 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 KIAA1456Q9P272 454 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.55□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 CACNA1FO60840 1977 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM202A6NGA9 273 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 WDR1O75083 606 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 CRLF1O75462 422 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 HEXAP06865 529 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SHMT1P34896 483 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 CHKAP35790 457 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 EFNA5P52803 228 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 RAD23BP54727 409 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 GNB1P62873 340 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 GTF2H2Q13888 395 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TAF11Q15544 211 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 LPAL2Q16609 132 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PLD5Q8N7P1 536 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 MORC4Q8TE76 937 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 STAMQ92783 540 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 COG8Q96MW5 612 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 EYA3Q99504 573 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 FKRPQ9H9S5 495 aa3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 IFNL4K9M1U5 179 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 INHBAP08476 426 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 PDE1BQ01064 536 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SLC1A5Q15758 541 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TADA2BQ86TJ2 420 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 MYCT1Q8N699 235 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 USP38Q8NB14 1042 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 SPATA5Q8NB90 893 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 FSD1Q9BTV5 496 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM160Q9NX00 188 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SKAP2-206ENST00000489977 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 PCDH7O60245 1069 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 RRM1P23921 792 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 BDKRB2P30411 391 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 MMP14P50281 582 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ANKRD1Q15327 319 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 TAF5Q15542 800 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 CCDC96Q2M329 555 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ZBTB2Q8N680 514 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 ELP4Q96EB1 424 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 EGFL8Q99944 293 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.52□□□□□ -1.85
SKAP2-206ENST00000489977 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms