RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD10O75832 226 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FTH1P02794 183 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF10Q13118 480 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1LQ5SGD2 360 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RASAL3Q86YV0 1011 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF248Q8NDW4 579 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CDT1Q9H211 546 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PNPOQ9NVS9 261 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 U3KQV3 271 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GSC2O15499 205 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FGF1P05230 155 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00032P0C843 101 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF4P15884 667 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 IQSEC1Q6DN90 963 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC34A3Q8N130 599 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP8Q8N3A8 854 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LEMD2Q8NC56 503 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIP3Q96DZ5 547 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH19Q9H159 772 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF19AQ9NV58 838 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CLUHO75153 1309 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN8A6NHC0 703 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MDM4O15151 490 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEC1O60732 1142 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 AMD1P17707 334 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MATKP42679 507 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR1P46091 355 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MAXP61244 160 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DET1Q7L5Y6 550 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HAS1Q92839 578 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB23Q9ULC3 237 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 URADA6NGE7 173 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PDHXO00330 501 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CASKO14936 926 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CTSKP43235 329 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R40P59535 323 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPK1Q13546 671 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TOMM20Q15388 145 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MEIOBQ8N635 442 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC2Q96KP1 924 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RTKNQ9BST9 563 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC28BQ9BUN5 200 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf4Q9NR00 106 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 EURLQ9NYK6 297 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HES2Q9Y543 173 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD11O00231 422 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TIPRLO75663 272 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LRATO95237 230 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MNDAP41218 407 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HKDC1Q2TB90 917 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO6A1Q86UG4 719 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LINGO1Q96FE5 620 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TSSK3Q96PN8 268 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CIB1Q99828 191 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN10Q9UBB4 475 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 H0Y858 1186 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 WFS1O76024 890 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHX2P34913 555 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms