RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V3G9 751 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF4O60810 478 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PMPCBO75439 489 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFRBP09619 1106 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LCP1P13796 627 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1B1P15313 513 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MX2P20592 715 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ACADSBP45954 432 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BAG6P46379 1132 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX3-2P78367 333 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NFATC3Q12968 1075 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD5Q16401 504 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ROPN1LQ96C74 230 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPER2Q96P56 530 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AIG1Q9NVV5 245 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QX08 132 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPC2O15144 300 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D4O60343 1298 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1G1O75348 118 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 POU4F1Q01851 419 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP15Q460N3 678 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC115Q96NT0 180 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VCX3BQ9H321 246 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD320Q9NPF0 282 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UBP1Q9NZI7 540 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP14A8MT82 685 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADM5C9JUS6 153 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ARNTLO00327 626 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MATN3O15232 486 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RASAL1O95294 804 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BAG2O95816 211 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP3P08254 477 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GFAPP14136 432 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IDO1P14902 403 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EPORP19235 508 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP5P24588 427 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MASP1P48740 699 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT3AP56704 352 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DSC1Q08554 894 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PID1Q7Z2X4 250 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL20Q96IG2 436 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FNIP2Q9P278 1114 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QYT0 321 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL22O00626 93 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MTSS1O43312 755 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMG1P04279 462 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGAP37287 484 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V0D1P61421 351 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CAP1Q01518 475 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4D1Q15615 310 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OLFML2BQ68BL8 750 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SBSNQ6UWP8 590 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 XKR5Q6UX68 686 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM74Q86UV6 250 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM73Q86UV7 250 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX19Q92543 992 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OSMRQ99650 979 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NANOGQ9H9S0 305 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SERHLQ9NQF3 203 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
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