RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCAPG2Q86XI2 1143 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDSS2Q86YH6 399 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4D11Q8NGI4 311 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSH3Q8TE77 659 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LPAR1Q92633 364 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM159Q96B96 161 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXL20Q96IG2 436 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C18orf12Q96KH6 178 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEDD4LQ96PU5 975 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DPH1Q9BZG8 443 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM4Q9C037 500 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCSER2Q9H7U1 834 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POPDC2Q9HBU9 364 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NECAP2Q9NVZ3 263 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STK32BQ9NY57 414 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIS18AQ9NYP9 233 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADA2Q9NZK5 511 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRIPTQ9P021 101 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRIT1Q9P2V4 623 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSGIN2Q9Y236 505 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRBP23467 1997 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF532Q9HCE3 1301 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWA8A3KMH1 1905 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A087WTM6 91 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PRG0 241 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGAP5A6NIR3 686 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP27XA6NNY8 438 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf67F2Z3F1 127 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD5LO43866 347 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALDH1L1O75891 902 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VNN1O95497 513 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFNA1P01562 189 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT18P05783 430 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSF1RP07333 972 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM87AP0C7U9 286 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BMP3P12645 472 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRF1P14222 555 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCKDHBP21953 392 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP8P22894 467 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCA1P28370 1054 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GKP32189 559 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTKP33981 857 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLRBP48167 497 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DIO1P49895 249 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APLP1P51693 650 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CABP4P57796 275 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXL2P58012 376 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRWD1-AS2P59051 145 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APLP2Q06481 763 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRDX4Q13162 271 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEMA3BQ13214 749 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNJ12Q14500 433 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF141Q15928 474 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKPD1Q17RQ9 610 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBWD6Q4V339 395 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF789Q5FWF6 425 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBWD3Q5JTY5 395 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBWD5Q5RIA9 395 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBPF6Q5VWK0 638 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BICRALQ6AI39 1079 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf54Q6UWD8 224 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REC114Q7Z4M0 266 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOC3L1Q86VI1 746 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIAH3Q8IW03 269 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GALNT4Q8N4A0 578 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MARVELD2Q8N4S9 558 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDHD1Q8NEL9 900 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5B17Q8NGF7 314 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52N2Q8NGI0 321 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHDC4Q8TBB5 520 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDM1Q8TC05 714 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHPN1Q8TCX5 695 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HPS3Q969F9 1004 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO17Q96EF6 278 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GIMAP5Q96F15 307 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRSS27Q9BQR3 290 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGMATQ9BSE5 352 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTPALQ9BTX7 342 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARD10Q9BWT7 1032 aa-3.56□□□□□ -2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms