RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 VMP1Q96GC9 406 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA13Q96N96 652 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTT2P0CG29 244 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CHKAP35790 457 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PBX1P40424 430 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NTRK3Q16288 839 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MIIPQ5JXC2 388 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM25EA8MYX2 175 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC37A4O43826 429 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 USP12O75317 370 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2F1P24903 491 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBED5Q49AG3 693 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS35Q96QK1 796 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PIDD1Q9HB75 910 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF358Q9NW07 568 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB14O43829 449 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGNO95427 931 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRE1Q14246 886 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 F5H6K3 240 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 WRBO00258 174 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CASKO14936 926 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TIPRLO75663 272 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM8P78325 824 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF45Q02386 682 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 KLRC3Q07444 240 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CBLBQ13191 982 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PCID2Q5JVF3 399 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 M0QYT0 321 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DFNA5O60443 496 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GCATO75600 419 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LTFP02788 710 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF181Q2M3W8 571 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TDRPQ86YL5 185 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF614Q8N883 585 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MASTLQ96GX5 879 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A087X0B3 334 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SCELO95171 688 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 AXLP30530 894 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MPP1Q00013 466 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP7B1O75881 506 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2B6P58173 313 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 EXD2Q9NVH0 621 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LAMA4Q16363 1823 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 FADS2P1A8MWK0 482 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C8BP07358 591 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NR2C1P13056 603 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGP20916 626 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH4A1P30038 563 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CRHR1P34998 444 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MARC1Q5VT66 337 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PDSS2Q86YH6 399 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GNG2P59768 71 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DEF8Q6ZN54 512 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 EVPLQ92817 2033 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TADA2AO75478 443 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MT-CO1P00395 513 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ORC1Q13415 861 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GIT2Q14161 759 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFA9Q16795 377 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 BORAQ6PGQ7 559 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MECRQ9BV79 373 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PHF24Q9UPV7 400 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CLCA1A8K7I4 914 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RGL2O15211 777 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TGFB3P10600 412 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COX7A2P14406 83 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF3P17036 446 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SYT16Q17RD7 645 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 AADACL2Q6P093 401 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 AFTPHQ6ULP2 937 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 KAT5Q92993 513 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 HGH1Q9BTY7 390 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DDIT4Q9NX09 232 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COG5Q9UP83 839 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms