RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 GALNT3Q14435 633 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC6AQ6EIG7 209 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PSKH2Q96QS6 385 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFA13Q9P0J0 144 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 DNMT3LQ9UJW3 386 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 H0YJX3 145 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ACSL4O60488 711 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJA2O60884 412 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 STAMBPO95630 424 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 SLC11A2P49281 568 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V0D1P61421 351 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 RHDQ02161 417 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 AFTPHQ6ULP2 937 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 GALNT15Q8N3T1 639 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 STAG3L4Q8TBR4 150 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PKP2Q99959 881 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL2Q9BWV7 592 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 DERL2Q9GZP9 239 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC68Q9H2F9 335 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CCSER2Q9H7U1 834 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC189A1A4V9 331 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 AZIN1O14977 448 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K13O43283 966 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D4O60343 1298 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 VPS4BO75351 444 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ELNP15502 786 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TLR1Q15399 786 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 FBXL19Q6PCT2 694 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PAOXQ6QHF9 649 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CYHR1Q6ZMK1 362 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 LILRA2Q8N149 483 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PNPLA1Q8N8W4 532 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1191Q96A73 305 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ATOH8Q96SQ7 321 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CD300AQ9UGN4 299 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 AP4S1Q9Y587 144 aa19.53■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PFDN6O15212 129 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 KERAO60938 352 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 CDK14O94921 469 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PSMA3P25788 255 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 SH3BP2P78314 561 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA3AQ14563 771 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 IL31Q6EBC2 164 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 FUT10Q6P4F1 479 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ANKS3Q6ZW76 656 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ARPINQ7Z6K5 226 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 EFHD1Q9BUP0 239 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 VWA8A3KMH1 1905 aa19.52■□□□□ 0.72
SPNS1-201ENST00000311008 LCHNA4D1U4 455 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 SLC38A8A6NNN8 435 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 SYCE1LA8MT33 242 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 MTHFD2P13995 350 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 GFAPP14136 432 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 OR4D1Q15615 310 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 KANK2Q63ZY3 851 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 PRMT9Q6P2P2 845 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 MYEOVQ96EZ4 313 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 AKTIPQ9H8T0 292 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 MID1IP1Q9NPA3 183 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFAF1Q9Y375 327 aa19.52■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 C2orf81A6NN90 581 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 KDELR3O43731 214 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 GJB3O75712 270 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 RHOBTB1O94844 696 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 GPX3P22352 226 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 KCNQ1P51787 676 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 OXCT1P55809 520 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-201ENST00000311008 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms