RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 GLYATQ6IB77 296 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TMEM135Q86UB9 458 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TERB1Q8NA31 727 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HSFY1Q96LI6 401 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ZBTB18Q99592 522 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 EGFL8Q99944 293 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 A0A087X1B8 175 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ZNF682O95780 498 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 COL6A2P12110 1019 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 POU4F1Q01851 419 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HERC3Q15034 1050 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NOTUMQ6P988 496 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NPWQ8N729 165 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MRGBPQ9NV56 204 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.3■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NME4O00746 187 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 EMP3P54852 163 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 POC5Q8NA72 575 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CEP19Q96LK0 163 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NDUFS3O75489 264 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 BEST1O76090 585 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CD4P01730 458 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PRKCGP05129 697 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 LGALS2P05162 132 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 GJA8P48165 433 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PIK3CGP48736 1102 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CD97P48960 835 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 GRB7Q14451 532 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 INAQ16352 499 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 SV2CQ496J9 727 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MIB1Q86YT6 1006 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CLDN25C9JDP6 229 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 SEC24AO95486 1093 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CST1P01037 141 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CYP2B6P20813 491 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PRKACGP22612 351 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FMO4P31512 558 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 OAZ1P54368 228 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 WNT3AP56704 352 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PPIL2Q13356 520 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PAGE2Q7Z2X7 111 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CARM1Q86X55 608 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 LSMEM2Q8N112 164 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TEKT5Q96M29 485 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 BIRC8Q96P09 236 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.29■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 H0Y858 1186 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PSMD3O43242 534 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FKBP9O95302 570 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FUCA1P04066 466 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HSMCR30P0CW71 290 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ALOX12P18054 663 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MAGEA6P43360 314 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 GSK3BP49841 420 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TNK2Q07912 1038 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NFATC3Q12968 1075 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MEP1AQ16819 746 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ACOX2Q99424 681 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 FTH1P02794 183 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 MTHFRP42898 656 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 CD300CQ08708 224 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 PTPRCAPQ14761 206 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 LAPTM4AQ15012 233 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 KYAT1Q16773 422 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 ABI1Q8IZP0 508 aa15.28■□□□□ 0.04
USP25-201ENST00000285679 TFAP2CQ92754 450 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms