RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FntaQ61239 377 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt14Q61781 484 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pick1Q62083 416 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DazlQ64368 298 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Papd7Q6PB75 542 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mvb12aQ78HU3 271 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aggf1Q7TN31 711 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1198Q7TR12 308 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pnma8aQ80VM8 430 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgap15Q811M1 481 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rspo2Q8BFU0 243 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arrb1Q8BWG8 418 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8CD60 292 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc38Q8CDN8 563 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cnot6Q8K3P5 557 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt79Q8VED5 531 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cbwd1Q8VEH6 393 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Brinp1Q920P3 760 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube2sQ921J4 223 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pard3bQ9CSB4 1203 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RpainQ9CWY9 219 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyc1Q9D0M3 325 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Galnt15Q9D2N8 638 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sdr42e1Q9D665 394 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AcoxlQ9DBS4 632 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SyncQ9EPM5 470 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slco2a1Q9EPT5 643 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Barx1Q9ER42 254 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FignQ9ERZ6 759 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rtn3Q9ES97 964 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Padi1Q9Z185 662 aa5.48□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itga8A2ARA8 1062 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bpifb4A2BGH0 617 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trabd2bB1ATG9 517 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r27D3YUK6 857 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zscan4bE9Q3G0 505 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm1758F6VZZ1 202 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10378F6XQQ1 160 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scgb2b19J3QM75 112 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agpat1O35083 285 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr27O54897 379 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grk4O70291 574 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pde9aO70628 534 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sod1P08228 154 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AgtP11859 477 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vav1P27870 845 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gad1P48318 593 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr85P60894 370 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnab2P62482 367 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rtel1Q0VGM9 1203 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpat2Q14DK4 801 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q3TQQ9 903 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo7Q3U7U3 523 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ntrk1Q3UFB7 799 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam8a1Q3URQ4 399 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pex1Q5BL07 1284 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fzd3Q61086 666 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pde1aQ61481 565 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DbhQ64237 622 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbr1Q64336 681 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RragbQ6NTA4 374 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ctdp1Q7TSG2 960 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Epn1Q80VP1 575 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcas1Q80YN3 633 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Erlin2Q8BFZ9 340 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B3glctQ8BHT6 489 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 D130040H23RikQ8BII3 405 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phactr3Q8BYK5 558 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf451Q8C0P7 1056 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8C5C9 218 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Apol9bQ8C7I4 310 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dclre1bQ8C7W7 541 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rassf9Q8K342 435 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spata4Q8K3V1 295 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tspan33Q8R3S2 283 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Erlec1Q8VEH8 483 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sntg2Q925E0 539 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clcc1Q99LI2 539 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smtnl1Q99LM3 459 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r53Q9EP93 310 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Copb1Q9JIF7 953 aa5.47□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actl7bQ9QY83 418 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.5 ms