RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tsga8Q9JJL0 238 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh22Q9WTP5 813 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn3Q9Z0G9 219 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ces1bD3Z5G7 567 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adamts14E9PX39 1209 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gria1P23818 907 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdo1P60334 200 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cct7P80313 544 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam198aQ3UY90 562 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata20Q80YT5 790 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf38Q8BI21 518 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TwnkQ8CIW5 685 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Impg1Q8R1W8 798 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Depdc7Q91WS7 511 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B4galt3Q91YY2 395 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nck1Q99M51 377 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Retreg3Q9CQV4 466 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GabarapQ9DCD6 117 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp236S4R299 1847 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp963D3Z2T8 383 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 XntrpcF8VQM8 1264 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8011K7N6Y5 207 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ikzf3O08900 507 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hcn1O88704 910 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkn2bP55271 130 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Erp29P57759 262 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SiaeP70665 541 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PkdccQ5RJI4 492 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt10Q6P9S7 603 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msl1Q6PDM1 616 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phf24Q80TL4 400 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem39bQ810L4 492 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx16Q8BVI5 326 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgef33Q8BW86 850 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps26bQ8C0E2 336 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1250Q8VGM3 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PglsQ9CQ60 257 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ranbp3Q9CT10 491 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acbd6Q9D061 282 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mgea5Q9EQQ9 916 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gprc5dQ9JIL6 344 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med20Q9R0X0 212 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map3k6Q9WTR2 1291 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nme4Q9WV84 186 aa9.95□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lcn11A2BHR2 178 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ceacam3E9Q6J4 706 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17535J3KMR8 224 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HgdO09173 445 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01668 110 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Csf1rP09581 977 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb2P12388 415 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Svs4P18419 113 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alox5P48999 674 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hbq1bQ3U0A6 142 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndst1Q3UHN9 882 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mocs1Q5RKZ7 636 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc5a10Q5SWY8 596 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acot5Q6Q2Z6 421 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmd11Q8BG32 422 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp43Q8BUM9 1132 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr59Q8C0M0 992 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppm1fQ8CGA0 452 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Asb2Q8K0L0 634 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r215Q8R264 300 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FggQ8VCM7 436 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dph2Q9CR25 489 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SerhlQ9EPB5 311 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il22bQ9JJY8 179 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B4galt5Q9JMK0 388 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nufip1Q9QXX8 484 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gsk3bQ9WV60 420 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7694J3QNH8 270 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtnd4P03911 459 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ApoeP08226 311 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bmpr1aP36895 532 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ThrbP37242 461 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpx3P46412 226 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arl1P61211 181 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pla2g5P97391 137 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pla2g6P97819 807 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 UcmaQ14BU0 138 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3414Q3TNU4 584 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hist2h2acQ64523 129 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpina3aQ6P4P1 422 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dclk2Q6PGN3 756 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PoliQ6R3M4 717 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sgo2Q7TSY8 1164 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a15Q8BG16 729 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dis3lQ8C0S1 1053 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acsf2Q8VCW8 615 aa9.94□□□□□ -0.82
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CarfQ8VHI4 689 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.6 ms