RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 SERPINB6P35237 376 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 GNPDA1P46926 289 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 HCAR3P49019 387 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 KRT81Q14533 505 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 AFMIDQ63HM1 303 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 USP45Q70EL2 814 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 SPRED1Q7Z699 444 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 PIM3Q86V86 326 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 GPR156Q8NFN8 814 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 MED8Q96G25 268 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 FAM117AQ9C073 453 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 APPL1Q9UKG1 709 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-205ENST00000596282 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.15□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 LRCH4O75427 683 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SERPINC1P01008 464 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CCNB1P14635 433 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ITIH1P19827 911 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM23P36406 574 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 MMP13P45452 471 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 EPHB1P54762 984 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CDH6P55285 790 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TPM4P67936 248 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SKOR1P84550 965 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 NCAPHQ15003 741 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 BOLA3Q53S33 107 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 MARC1Q5VT66 337 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 DOK6Q6PKX4 331 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PCSK4Q6UW60 755 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TTC9Q92623 222 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 LGR4Q9BXB1 951 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM7Q9C029 511 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 B8ZZF3 427 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SLC28A2O43868 658 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 NOBOXO60393 691 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PRAMEF10O60809 474 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CPNE6O95741 557 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SKILP12757 684 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 AMPD1P23109 780 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PCK1P35558 622 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ETV3P41162 512 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 GPR1P46091 355 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 MAXP61244 160 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 DPYSQ14117 519 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TGIF1Q15583 401 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CNGA3Q16281 694 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 KCTD16Q68DU8 428 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 USP7Q93009 1102 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 SGF29Q96ES7 293 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 COQ10AQ96MF6 247 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CDH19Q9H159 772 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 RDH14Q9HBH5 336 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 NOD2Q9HC29 1040 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 PSMD11O00231 422 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CTPS1P17812 591 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CA4P22748 312 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 CD82P27701 267 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-205ENST00000596282 GJC1P36383 396 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms