RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCNK16Q96T55 309 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAD9AQ99638 391 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A088AWK7 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 USP1O94782 785 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DNTTP04053 509 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TYMPP19971 482 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ENPP1P22413 925 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP3A7P24462 503 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HSD3B2P26439 372 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CARD18P57730 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 B2MP61769 119 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF33BQ06732 778 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALLCQ8N6M5 410 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF25Q93038 417 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HAPLN3Q96S86 360 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FNIP2Q9P278 1114 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL3Q9UH77 587 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SHOXO15266 292 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS3O75489 264 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1BO75688 479 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-10P10266 1014 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CD40LGP29965 261 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HTR2BP41595 481 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RPIAP49247 311 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW4P57775 412 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TWF1Q12792 350 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SP140Q13342 867 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AFMIDQ63HM1 303 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EXD1Q8NHP7 514 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZIM3Q96PE6 472 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A4Q9H015 551 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CD274Q9NZQ7 290 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MED11Q9P086 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 E2F8A0AVK6 867 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 E9PBE3 544 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH8O95206 1070 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SYPP08247 313 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ITGB6P18564 788 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CD52P31358 61 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NR2C2P49116 596 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NEK3P51956 506 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DSG2Q14126 1118 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HERC3Q15034 1050 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RFFLQ8WZ73 363 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TBCBQ99426 244 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EGFL8Q99944 293 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAD54BQ9Y620 910 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LTN1O94822 1766 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms